木村秋則從小在青森縣津輕郡長大，他自小就有異常的好奇心，喜歡對機械與自然問題探索究竟。他娶了妻子美榮子後，繼承了嶽父的蘋果員，全家就以種植蘋果為生。但不久後木村發現美榮子對噴灑農藥嚴重過敏。為了妻子的健康，木村開始研究如何種植無農藥的蘋果。
但蘋果是人類經過千年基因改造的水果，對自然界的病害與蟲害抵抗力很低，是所謂「上帝的禁果」。木村堅持使用自然農法，經過十年散盡家材，舉家陷入經濟困境，同時還要承受村人異洋的眼光，最後連壹向支持他堅持到底的媽媽也勸他放棄。木村會向傳統投降，恢復使用農藥，還是上帝會眷顧他，賜予他「奇蹟蘋果」呢？
