《最後的99天》取材於真實的歷史事件。 本片講述了解放前夕,在距新政協預定的會期還有99天之際,上海地下黨為了爭取並掩護民主人士北上參加第一屆新政協會議,一對同父異母的兄弟即共產黨人肖昆和國民黨軍官肖鵬之間,展開殊死搏鬥的故事。